DSpace Collection:https://opendata.uni-halle.de//handle/497920112/1598922024-03-19T02:40:11Z2024-03-19T02:40:11ZMolecular phylogenetic analyses and classification of the Pooideae (Poaceae) - [kumulative Dissertation]Schneider, Ulrike Juliahttps://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/79282023-12-07T11:52:43Z2013-01-01T00:00:00ZTitle: Molecular phylogenetic analyses and classification of the Pooideae (Poaceae) - [kumulative Dissertation]
Author(s): Schneider, Ulrike Julia
Abstract: Die Pooideae sind eine der größten Unterfamilien innerhalb der Gräser mit ungefähr 150 Gattungen und 3300 Arten. Um offene Fragen zur Phylogenie und Systematik der Unterfamilie Pooideae zu klären, wurden molekular-phylogenetische Analysen unter Verwendung der chloroplastidären Genregion matK–3’trnK und der ITS-Region (internal transcribed spacer) des Kerngenoms durchgeführt. Zusätzlich wurden morphologische Merkmale umfangreich untersucht und im Zusammenhang mit molekularen, cytogenetischen und biogeographischen Daten diskutiert. Die Ergebnisse legen eine Überarbeitung der traditionellen Gliederungskonzepte der Unterfamilie nahe. Folgende Klassifikation für die Pooideae wird vorgeschlagen: Brachyelytreae, Nardeae mit den Subtriben Nardinae and Lygeinae, Meliceae mit den Subtriben Brylkiniinae und Melicinae, Duthieeae, Phaenospermateae, Stipeae mit den Subtriben Ampelodesminae und Stipinae, Diarrheneae, Brachypodieae, Hordeeae (syn. Triticeae) mit den Subtriben Brominae, Hordeinae und Littledaleinae, und Aveneae/Poeae Tribus-Komplex. Weiterhin zeigt die Studie, dass die kleine Tribus Hainardieae stark polyphyletisch ist. Ihre Gattungen sind Mitglieder verschiedener Gruppen des Aveneae/Poeae Tribus-Komplexes. Insgesamt gibt die Dissertation neue Einblicke in die Klassifikation der Gräser-Unterfamilie Pooideae, einschließlich der Beschreibung einer neuen Tribus Duthieeae und der veränderten Umgrenzung der Triben Nardeae and Hordeeae.; The Pooideae is one of the largest subfamilies of grasses with approximately 150 genera and 3,300 species. To address unresolved questions concerning phylogeny and systematics of the subfamily Pooideae, molecular phylogenetic analyses were carried out using the chloroplast gene region matK–3’trnK and the nuclear internal transcribed spacers (ITS). Furthermore, morphological characters were extensively examined and discussed with respect to molecular, cytogenetic and biogeographical data. The new findings give strong evidence to modify the taxonomic treatment of major lineages within this subfamily. The following classification of Pooideae is proposed: Brachyelytreae, Nardeae with the subtribes Nardinae and Lygeinae, Meliceae with the subtribes Brylkiniinae and Melicinae, Duthieeae, Phaenospermateae, Stipeae with the subtribes Ampelodesminae and Stipinae, Diarrheneae, Brachypodieae, Hordeeae (syn. Triticeae) with the subtribes Brominae, Hordeinae and Littledaleinae and the Aveneae/Poeae tribe complex. Furthermore, the study shows that the small grass tribe Hainardieae is highly polyphyletic. Its genera are members of different groups among the Aveneae/Poeae tribe complex. In conclusion, the thesis gives new insights into the classification of the grass subfamily Pooideae, including the description of the new tribe Duthieeae and a revised treatment of the tribes Nardeae and Hordeeae.2013-01-01T00:00:00ZPhylogenetic relationships and diversification processes in Allium subgenus MelanocrommyumGurushidze, Maiahttps://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/73872023-12-07T11:54:21Z2009-01-01T00:00:00ZTitle: Phylogenetic relationships and diversification processes in Allium subgenus Melanocrommyum
Author(s): Gurushidze, Maia
Abstract: Innerhalb der Gattung Allium (Alliaceae) ist Melanocrommyum eine der größten Untergattung mit ca. 150 vor allem diploiden, an Trockenheit angepassten, eurasisch verbreiteten Arten. Die Untergattung ist taxonomisch schwer zu fassen, was sich in verschiedenen, zum Teil widersprechenden Klassifikationen widerspiegelt. In dieser Arbeit wurden folgende Punkte beantwortet, um die Evolutionsgeschichte von Melanocrommyum zu untersuchen: (i) phylogenetische Beziehungen, (ii) Evolution der Genomgrößen-Variation, (iii) Datierung der Diversifizierung innerhalb der Untergattung. Die phylogenetischen Beziehungen wurden mittels Sequenzierung der Spacer nukleärer rDNA (ITS) sowie der trnL-F Region des Chloroplastengenoms für jeweils mehrere Individuen von 110 Arten untersucht. Diese Arbeit deckt damit das gesamte geographische Verbreitungsgebiet der Untergattung, sowie nahezu alle Sektionen ab. Die molekulare Phylogenie stand im Widerspruch zu der bisher gängigen taxonomischen Klassifikation der Untergattung, da die meisten Sektionen polyphyletische Gruppierungen bildeten. In drei Arten, A. stipitatum, A. rosenorum und A. darwasicum wurden durch die molekularen Marker kryptische Linien nachgewiesen. In zwei Fällen (A. stipitatum und A. rosenorum) sind diese Linien nah verwandt, jedoch geographisch getrennt. In A. darwasicum hingegen liegen die kryptischen Linien in entfernten Kladen des phylogenetischen Baumes, haben aber keine differenzierte geographische Verbreitung. Somit ist A. darwasicum ein seltenes Beispiel für morphologisch nicht zu unterscheidende diploide kryptische Arten, die in gemischten Populationen vorkommen und nicht in einem Schwestergruppenverhältnis stehen. Die Genomgrößen von 70 Arten wurden mit Durchflusszytometrie bestimmt und im phylogenetischen Zusammenhang analysiert. Mittels Phylogenetic Generalized Least Squares (PGLS) wurden die Genomgrößen für die Knoten des phylogenetischen Baumes abgeschätzt. Diese Abschätzung von Vorläufer-Genomgrößen ergab, dass in der Untergattung sowohl Linien mit ab- als auch mit zunehmenden 2C-Werten vorkommen. Eng verwandte Arten weisen ähnliche Genomgrößen auf, während zwischen unterschiedlichen Verwandtschaftsgruppen deutlich größere Differenzen in den 2C-Werten auftreten. Um die Entstehung der Gattung Allium, ihre Biogeographie, die disjunkte Verbreitung in Eurasien und Nordamerika sowie Radiationen innerhalb der Gattung zeitlich einordnen zu können wurden molekulare Datierungsmethoden (molecular clock) angewendet. Die Analysen deuten eine Entstehung der Gattung Allium im frühen Tertiär an und belegen Vikarianz für die nordamerikanisch-eurasische Verbreitung. Die Ergebnisse dieser Doktorarbeit lassen erstens auf zwei Haupt-Differzifizierungsereignisse innerhalb der Untergattung Melancrommyum schließen, und zeigen zweitens, dass Hybridisierung und Polyploidie keine sehr wichtige Rolle bei diesen Radiationen spielten. Diese Resultate, sowie das Fehlen ausgeprägter adaptiver phenotypischer Differenzierung in Melanocrommyum Arten, unterstützen die Hypothese von nicht-adaptiver Artbildung, gefördert durch neu entstandene Trockenhabitate, die sich während der ausgeprägten Aridifizierung im Oberen Tertiär in Zentral- und Südwestasien bildeten, sowie durch Migration und Teilung von Populationen während der Klimaschwankungen des Quartär.2009-01-01T00:00:00ZMolekulare Phylogenie der Hafer-Gräser (Poaceae: Pooideae: Aveneae)Döring, Elkehttps://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/69172023-12-07T11:17:02Z2009-01-01T00:00:00ZTitle: Molekulare Phylogenie der Hafer-Gräser (Poaceae: Pooideae: Aveneae)
Author(s): Döring, Elke
Abstract: Zur Klärung systematischer Fragen innerhalb der Gräser-Familie (Poaceae) wurden von 171 Taxa aus 120 Gattungen die plastidären matK-Sequenzen mittels Maximum-Parsimony und bayesischen Methoden analysiert. Die untersuchten Taxa stammen zum größten Teil aus den Triben Aveneae und Poeae, aber auch aus weiteren Triben der Unterfamilie Pooideae und anderen Unterfamilien der Poaceae. Die vorliegenden Ergebnisse unterstützen eine weit gefasste Unterfamilie Pooideae mit Brachyelytrum und Nardus/Lygeum als basale Linien. Die Polytomie, inkl. einer nicht gestützten Abzweigung, aus den sehr gut unterstützten Triben Meliceae und Stipeae (inkl. Ampelodesmos) sowie der schwach gestützten Gruppe aus dem Subtribus Duthieinae (Aveneae) + Anisopogon + Phaenosperma ist Schwester zu Aveneae/Poeae + Bromeae/Triticeae + Brachypodium + Diarrhena. Brachypodium, mit Diarrhena in einer Polytomie stehend, ist wiederum Schwester zu den sehr gut gestützten Aveneae/Poeae + Bromeae/Triticeae. Die Aveneae/Poeae spalten sich in zwei Clades auf, welche nicht mit den traditionellen Triben Aveneae und Poeae identisch sind. Die Position vieler Gattungen und Gruppen in beiden Clades wurde diskutiert. Dafür wurden morphologischen, biogeographischen, ökologischen und neuesten taxonomischen Erkenntnissen mit einbezogen. Aufgrund morphologischer und molekularer Daten wird eine Vereinigung der monotypischen Gattungen Lygeum (Lygeeae) und Nardus (Nardeae) unter einer Tribus Nardeae vorgeschlagen. Die Taxa der Subtribus Duthieinae müssen aus den Aveneae ausgeschlossen werden. Sie stehen zusammen mit Anisopogon und den Phaenospermateae in einem Clade in der Nähe der Stipeae. Die Stellung von Brachypodium als eigenständige Tribus Brachypodieae wird unterstützt, während die Tribus Hainardieae und Seslerieae in den Aveneae/Poeae-Komplex aufgehen. Milium (früher Stipeae) und Anthochloa und Catabrosa (früher Meliceae) erscheinen hingegen als Mitglieder der Aveneae/Poeae.2009-01-01T00:00:00ZPhylogeny of Eurasian Stipeae, genetic structure and seed germination of Stipa spp. in JordanHamasha, Hassan Refaihttps://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/67902023-12-07T11:50:21Z2010-01-01T00:00:00ZTitle: Phylogeny of Eurasian Stipeae, genetic structure and seed germination of Stipa spp. in Jordan
Author(s): Hamasha, Hassan Refai
Abstract: Das Ziel der vorliegenden Dissertation war es, den Einfluss von Umweltbedingungen auf die genetische Diversität, die genetische Struktur und das Keimungsverhalten von vier jordanischen Stipa-Arten zu untersuchen, sowie eine phylogenetische Analyse der eurasischen Stipeae anzufertigen. Die jordanischen Stipa-Arten reagierten unterschiedlich entlang eines Umweltgradienten: die ruderalen S. capensis und S. parviflora wiesen höhere genetische Diversität auf als die beiden Halbwüstenarten S. arabica und S. lagascae. Die genetische Differenzierung war jedoch stärker in den Halbwüstenarten ausgeprägt. Die genetische Diversität war nicht zufällig verteilt und die genetische Struktur nicht auf geographische Entfernung, sondern auf edaphische und klimatische Einflüsse zurückzuführen. Das Keimungsverhalten der Arten variierte zwischen Populationen; der Temperatureinfluss war artspezifisch. Die Phylogenie der eurasischen Stipa ergab fünf monophyletische Gruppen, und die vier jordanischen Stipa-Arten konnten zweien davon zugeordnet werden. Die "Kern" Gruppe von Stipa wurde bestimmt und der Ursprung amerikanischer und australischer Stipeae aufgedeckt.2010-01-01T00:00:00Z