https://opendata.uni-halle.de//handle/497920112/159887 2026-04-09T01:52:41Z https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/13703 Title: Comparative cytology and cytogenomics for representative species of the five duckweed genera Author(s): Phuong, Hoang Thi Nhu Abstract: Für die elf getesteten Arten wurde i) ein 14-facher Genomgrößenunterschied (von 160 bis 2203 Mbp, ii) eine positive Korrelation zwischen Genomgröße einerseits und Kern- und Zellvolumen andererseits, jedoch iii) keine Korrelation zwischen Genomgröße und artspezifischer Chromosomenzahl, bzw. Zahl der 5S/45S rDNA loci festgestellt. Fünf erhebliche Abweichungen zwischen der cytogenetischen Karte für den Klon 7498 und der optischen Bionano-Karte für Klon 9509 wurden auf fehlerhafte bzw. unvollständige Assemblierung in beiden Karten zurückgeführt und korrigiert. Fluoreszenz-in situ-Hybridisierung mit 106 BACs ergab keine Hinweise auf Genom-strukturunterschiede zwischen sieben getesteten klonalen Akzessionen von S. polyrhiza. Chromosomenhomöologie und Strukturumbauten zwischen den beiden Arten der Gattung, S. polyrhiza (2n = 40) und S. intermedia (2n = 36) ergaben komplexe Umbauten, die 10 Chromosomenpaare von S. polyrhiza und 8 von S. intermedia, betrafen. Alternative Szenarien für die Karyotypevolution innerhalb der Gattung wurden vorgestellt.; For the eleven tested duckweed species: (1) a ~14 fold genome variation (from 160 to 2203 Mbp) was measured; (2) a positive correlation between genome size and cell and nuclear volume was found; (3) Species-specific chromosome as well as 5S/45S rDNA loci numbers were not correlated with genome size. Five major discrepancies between the S. polyrhiza cytogenetic map (clone 7498) and BioNano map (clone 9509) due to mis-assemblies or incompleteness in former studies were resolved. No clone-specific chromosome rearrangement was detected between seven tested S. polyrhiza clones after FISH with 106 BACs. Chromosome homeology and rearrangements between S. intermedia (2n = 36) and S. polyrhiza (2n = 40) were studied and revealed complex rearrangements involving 10 chromosome pairs of S. polyrhiza and 8 of S. intermedia. Alternative scenarios of karyotype evolution within the genus Spirodela are supposed. 2019-01-01T00:00:00Z https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/8525 Title: The global distribution of plant species richness in a human-dominated world - [kumulative Dissertation] Author(s): Gerstner, Katharina Abstract: Pflanzenreichtum ist essentiell für Ökosystemfunktionen, -stabilität und -dienstleistungen, ist jedoch global gefährdet durch Landnutzung. Bisherige Modelle zu Artenreichtum und dessen Veränderung basieren zumeist auf Art-Areal Beziehungen und machen die vereinfachenden Annahmen, dass Art-Areal-Beziehungen weltweit gleichförmig sind und Landnutzung zu unmittelbarem Habitatverlust führt. Diese Dissertation umfasst eine globale Art-Areal-Analyse, eine Meta-Analyse zur Quantifizierung von Landnutzungseffekten auf Pflanzenreichtum und einer Modellstudie zur Parametrisierung eines Landschafts-Art-Areal Modells für die Verteilung von Pflanzenreichtum in Europa, welches Landnutzungseffekte in Art-Areal-Modelle integriert. Sie fördert somit ein tieferes Verständnis von Art-Areal Beziehungen und wie Artenreichtum über große Bandbreite räumlicher Skalen von Landnutzung beeinflusst wird und präsentiert ein Modell, welches durch die Integration von Landnutzung und dessen vielfältige Effekte eine deutliche Verbesserung gegenüber existierenden Modellen darstellt.; Plant species richness is essential for ecosystem functioning, resilience, and, ultimately, ecosystem services, yet it is globally threatened by anthropogenic land use including management and modification of natural environment. At very large scales land-use effects are often simply modelled by habitat loss assuming that transformed land becomes completely inhospitable for naturally occuring species. Further, estimates of species loss are flawed by the common assumption of a universal slope of the species-area curve, typically ranging from 0.15 to 0.25 or 0.35. This dissertation consists of a global species-area analysis, a meta-analysis about land-use effects on plant species richness and an approach to integrate these land-use effects in a countryside species-area model. It thereby contributes to a deeper understanding of species-area relationships and how patterns of species richness across spatial scales are driven by land use and suggests a model to predict species richness pattern of vascular plants that overcomes limitations of previous models. 2016-01-01T00:00:00Z https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/8057 Title: High copy sequences reveal the unique composition and evolution of the rye B chromosome Author(s): Klemme, Sonja Abstract: B Chromosomen (Bs) sind überzählige Chromosomen, die zwischen Individuen einer Spezies in ihrer Anzahl variieren können. Da die Bs entbehrlich sind und ihre Vererbung unabhängig von den Mendelschen Gesetzen ist, darf man annehmen, dass ihre Evolution einen anderen Weg beschreitet als die der A Chromosomen (As). Dies ist auch ersichtlich in der Zusammensetzung ihrer repetitiven DNA. Wir geben Einsicht in die Zusammensetzung und Verteilung von stark amplifizierten Sequenzen auf dem B von Roggen (Secale cereale L.). Die auf dieser Arbeit beruhende zytologische Karte des Roggen-Bs liefert ein nützliches Werkzeug für zukünftige Studien zu diesem rätselhaften Chromosomentyp. Unter anderem haben wir die Möglichkeit etabliert, das B während der Interphase zu markieren. Unsere Erkenntnisse heben die Unterschiede zwischen A und B Chromosomen hervor. Obwohl Bs ursprünglich von As abstammen, haben sie seither einen eigenen Evolutionsweg eingeschlagen und sind daher ein wertvolles Werkzeug zur Erforschung der Chromosomenevolution.; B chromosomes (Bs) are supernumerary chromosomes that vary in number between individuals of the same species. Because of the dispensable nature of the Bs and their non-Mendelian inheritance, one might assume the B followed a different evolutionary pathway than the A chromosomes (As). This is reflected by differences in their highcopy DNA constitution. We provide a deep insight into the composition and distribution of rye (Secale cereale) B-located high-copy sequences. This work provides a cytogenetic map of the rye B chromosome. This map may serve as a tool for further research on this enigmatic chromosome type. We established the possibility to reliably identify Bs during interphase. Our findings highlight the differences between A and B chromosomes. Although Bs originated in As, they have taken a separate evolutionary pathway and are an invaluable research tool for studies on chromosome evolution. 2013-01-01T00:00:00Z https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/7928 Title: Molecular phylogenetic analyses and classification of the Pooideae (Poaceae) - [kumulative Dissertation] Author(s): Schneider, Ulrike Julia Abstract: Die Pooideae sind eine der größten Unterfamilien innerhalb der Gräser mit ungefähr 150 Gattungen und 3300 Arten. Um offene Fragen zur Phylogenie und Systematik der Unterfamilie Pooideae zu klären, wurden molekular-phylogenetische Analysen unter Verwendung der chloroplastidären Genregion matK–3’trnK und der ITS-Region (internal transcribed spacer) des Kerngenoms durchgeführt. Zusätzlich wurden morphologische Merkmale umfangreich untersucht und im Zusammenhang mit molekularen, cytogenetischen und biogeographischen Daten diskutiert. Die Ergebnisse legen eine Überarbeitung der traditionellen Gliederungskonzepte der Unterfamilie nahe. Folgende Klassifikation für die Pooideae wird vorgeschlagen: Brachyelytreae, Nardeae mit den Subtriben Nardinae and Lygeinae, Meliceae mit den Subtriben Brylkiniinae und Melicinae, Duthieeae, Phaenospermateae, Stipeae mit den Subtriben Ampelodesminae und Stipinae, Diarrheneae, Brachypodieae, Hordeeae (syn. Triticeae) mit den Subtriben Brominae, Hordeinae und Littledaleinae, und Aveneae/Poeae Tribus-Komplex. Weiterhin zeigt die Studie, dass die kleine Tribus Hainardieae stark polyphyletisch ist. Ihre Gattungen sind Mitglieder verschiedener Gruppen des Aveneae/Poeae Tribus-Komplexes. Insgesamt gibt die Dissertation neue Einblicke in die Klassifikation der Gräser-Unterfamilie Pooideae, einschließlich der Beschreibung einer neuen Tribus Duthieeae und der veränderten Umgrenzung der Triben Nardeae and Hordeeae.; The Pooideae is one of the largest subfamilies of grasses with approximately 150 genera and 3,300 species. To address unresolved questions concerning phylogeny and systematics of the subfamily Pooideae, molecular phylogenetic analyses were carried out using the chloroplast gene region matK–3’trnK and the nuclear internal transcribed spacers (ITS). Furthermore, morphological characters were extensively examined and discussed with respect to molecular, cytogenetic and biogeographical data. The new findings give strong evidence to modify the taxonomic treatment of major lineages within this subfamily. The following classification of Pooideae is proposed: Brachyelytreae, Nardeae with the subtribes Nardinae and Lygeinae, Meliceae with the subtribes Brylkiniinae and Melicinae, Duthieeae, Phaenospermateae, Stipeae with the subtribes Ampelodesminae and Stipinae, Diarrheneae, Brachypodieae, Hordeeae (syn. Triticeae) with the subtribes Brominae, Hordeinae and Littledaleinae and the Aveneae/Poeae tribe complex. Furthermore, the study shows that the small grass tribe Hainardieae is highly polyphyletic. Its genera are members of different groups among the Aveneae/Poeae tribe complex. In conclusion, the thesis gives new insights into the classification of the grass subfamily Pooideae, including the description of the new tribe Duthieeae and a revised treatment of the tribes Nardeae and Hordeeae. 2013-01-01T00:00:00Z