Skip navigation
Please use this identifier to cite or link to this item: http://dx.doi.org/10.25673/1456
Title: Integrative Analyse der Struktur und Dynamik metabolischer Modelle
Author(s): Hartmann, Anja
Referee(s): Schreiber, Falk, Prof. Dr.
Koch, Ina, Prof. Dr.
Granting Institution: Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg
Issue Date: 2015
Extent: Online-Ressource (153 Bl. = 25,27 mb)
Type: Hochschulschrift
Type: Doctoral Thesis
Exam Date: 20.04.2015
Language: German
Publisher: Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt
URN: urn:nbn:de:gbv:3:4-14377
Subjects: Bioinformatik
Biochemie
Biologisches System
Modellierung
Online-Publikation
Hochschulschrift
Abstract: Die Charakterisierung von Verhaltens- und Funktionsweisen biologischer Systeme stellt aufgrund vielfältiger biochemischer Interaktionen eine große Herausforderung dar. Verschiedene Modellierungsformalismen ermöglichen die Analyse metabolischer Modelle abhängig von der zu lösenden Fragestellung, dem biochemischen Wissen und der Verfügbarkeit experimentell erhobener Daten. In dieser Dissertation wird die Entwicklung einer Methodik zur integrativen Analyse der Struktur und Dynamik metabolischer Modelle beschrieben. Unter Verwendung verschiedener Modellierungs-formalismen können metabolische Modelle aus mehreren Perspektiven analysiert werden. Die integrative Visualisierung und interaktive Exploration der ermittelten strukturellen und dynamischen Eigenschaften führen zu einem umfassenden Verständnis biologischer Systeme. Das System Biology Metabolic Model Framework realisiert die entwickelte Methodik und wird zur integrativen Analyse der Kulturpflanzen Kartoffel und Mais angewendet.
The characterization of biological systems with respect to their behavior and functionality based on biochemical interactions is a major challenge. Different modeling formalisms allow metabolic models to be analyzed depending on the question to be solved, the biochemical knowledge and the availability of experimental data. This PhD thesis describes the development of a methodology for an integrative analysis of the structure and dynamics represented by metabolic models. Using various modeling formalisms metabolic models are analyzed from different perspectives. An integrated visualization and interactive exploration of determined structural and dynamic properties leads to a broader understanding of the underlying biological system. The System Biology Metabolic Model Framework implements the developed methodology and is applied for the integrative analysis of the crop plants potato and corn.
URI: https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/8227
http://dx.doi.org/10.25673/1456
Open Access: Open access publication
Appears in Collections:Biowissenschaften; Biologie

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Dissertation_AnjaHartmann.pdf25.88 MBAdobe PDFThumbnail
View/Open
Show full item record BibTeX EndNote


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.