Please use this identifier to cite or link to this item: http://dx.doi.org/10.25673/1594
Title: The functional characterization of mammalian non-coding Y RNAs - [kumulative Dissertation]
Author(s): Köhn, Marcel
Referee(s): Hüttelmaier, Stefan, Prof. Dr.
Wahle, Elmar, Prof. Dr.
Zenklusen, Daniel, Prof. Dr.
Granting Institution: Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg
Issue Date: 2015
Extent: Online-Ressource (58 Bl. = 2,36 mb)
Type: Hochschulschrift
Type: Doctoral Thesis
Exam Date: 05.11.2015
Language: English
Publisher: Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt
URN: urn:nbn:de:gbv:3:4-15772
Subjects: Online-Publikation
Hochschulschrift
Abstract: Diese Arbeit behandelt die Charakterisierung der nicht-kodierenden Y RNAs. Es wurden RNA pulldowns durchgeführt, um Y RNA-assoziierte Proteine zu identifizieren (z.B. das IGF2 mRNA-bindingprotein 1). Des Weiteren wurde gezeigt, dass mRNA-Prozessierungsfaktoren mit Y RNAs interagieren. Die Depletion von Y RNAs mittels antisense oligonucleotides (ASOs) verursachte Histone-spezifische Prozessierungsdefekte. Y3’s Rolle in der 3’-Endprozessierung ist nicht konserviert in der Maus, welches im Fehlen der kleineren Y3-Form Y3** begründet liegt. ASO- vs. siRNA-vermittelte Y3**-Depletion bestätigte die Rolle dieser RNA in der Histon-Prozessierung. Während Y3 und Y3** mit Prozessierungsfaktoren interagieren, kann nur Y3** mit Histon-mRNAs assoziieren. Außerdem beeinträchtigte die Depletion von Y3** die Morphologie/Dynamik von histonelocusbodies (HLBs). Zusammenfassend konnte gezeigt werden, dass Y3** Histone-mRNAProzessierung fördert, indem sie Prozessierungsfaktoren zu HLBs rekrutiert.
This thesis focused on the characterization of non-coding RNAs called Y RNAs.To identify Y RNA-associated proteins we performed RNA pulldowns. This identified Y RNA-binding proteinsincluding the IGF2 mRNA-binding protein 1. Furthermore we identified the association of mRNA processing factors with Y RNAs. Y RNA depletion by antisense oligonucleotides (ASOs) caused processing defectsspecific for histone mRNAs. Y3’s role in the 3’-end processing of histone mRNAs is not conserved in mouse, which is caused by the lack of a smaller Y3-variant, termed Y3**.ASO- vs. siRNA-directed depletion of Y3** revealed Y3** to be involved in histone mRNA processing. Furthermore,while Y3 and Y3**associate with processing factors, just Y3**associates with histone mRNAs. The depletion of Y3** impaired the morphology/dynamics of histone locus bodies (HLBs). In conclusion, these findings indicate that Y3** promotes processing of histone mRNAs acingas scaffold to recruit processing factors to HLBs.
URI: https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/8365
http://dx.doi.org/10.25673/1594
Open Access: Open access publication
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