Phylogenetic evaluation of chloroplast trnL–trnF DNA sequence variation in the genus Mammillaria (Cactaceae)

Abstract

HARPKE, D., PETERSON, A., HOFFMANN, M.H. & RÖSER, M. 2006: Phylogenetic evaluation of chloroplast trnL–trnF DNA sequence variation in the genus Mammillaria (Cactaceae). Schlechtendalia 14: 7–16. Die phylogenetischen Beziehungen zwischen 21 Vertretern der Cactaceae-Gattung Mammillaria wurden mittels DNA-Sequenzdaten der trnL–trnF Chloroplastenregion untersucht. Die Auswahl der Arten umfasste Vertreter aller Untergattungen (außer subg. Cochemiea) sowie aller Sektionenund Serien der großen Untergattung Mammillaria. Zur Auswertung der erhaltenen Daten wurde ein Sequenz-Alignment mit anschließender Stammbaum-Berechnung nach der neighbour-joining-Methode durchgeführt. Trotz geringer Unterschiede in der untersuchten trnL–trnF Region ließen sichRückschlüsse auf die phylogenetischen Verhältnisse innerhalb der Gattung Mammillaria ziehen. Der NJ-Baum zeigt, dass Mammillaria candida (subg. Mammilloydia) innerhalb der Gattung Mammillaria gruppiert, was die Einbeziehung der Gattung Mammilloydia unter Synonymie von Mammillaria unterstützt.Mammillaria mazatlanensis erwies sich als Schwester aller übrigen hier untersuchten Arten von Mammillaria.

HARPKE, D., PETERSON, A., HOFFMANN, M.H. & RÖSER, M. 2006: Phylogenetic evaluation of chloroplast trnL–trnF DNA sequence variation in the genus Mammillaria (Cactaceae). Schlechtendalia 14: 7–16. Phylogenetic relationships among 21 species of the large Cactaceae genus Mammillaria were investigated using DNA sequence data from the chloroplast intergenic region trnL–trnF. The study contains representatives of all subgenera (except subg. Cochemiea) of Mammillaria as well as the sections and series of M. subg. Mammillaria. Sequences were aligned and a neighbour-joining (NJ) tree was constructed. Although variation of the trnL–trnF intergenic region was low, the NJ tree showed that Mammillaria candida (subg. Mammilloydia) clustered within the genus Mammillaria which supports to include the segregate genus Mammilloydia Buxbaum under synonymy of Mammillaria. Mammillaria mazatlanensis was revealed as sister to the other Mammillaria species investigated.