WISP1-AS1, a long noncoding RNA, upregulated in human renal cells exposed to the mycotoxin ochratoxin A and in human renal cancer cells

Abstract

Das weltweit verbreitete Mykotoxin Ochratoxin A (OTA) kontaminiert Lebensmittel und schädigt menschliche Nieren. Durch OTA-Behandlung humaner Nierenzellen in Kultur, wurde eine lange nicht-kodierende RNA (lncRNA) im WISP1 (CCN4) -Lokus gefunden, die WISP1-AS1 gennant wurde. OTA ist bislang der einzige bekannte Induktor der WISP1-AS1, deren Funktionen unbekannt waren. In der vorliegenden Arbeit wurden die Eigenschaften und Funktionen der WISP1-AS1 in Bezug auf OTA-Toxizität und in Nierenkrebszellen untersucht. In humanen Nierenzellen (HEK293T) wurde die WISP1-AS1-Expression nur nach OTA-Behandlung hochreguliert. In Nierenkrebszellen (786-O) war die WISP1-AS1-Expression auch ohne OTABehandlung bereits enorm hoch, was auf eine mögliche Rolle der WISP1-AS1 in der Karzinogenese hinweist. Die WISP1-AS1-Transkription findet in Antisense in Bezug auf die WISP1-mRNA statt. Um zelluläre Merkmale in Gegenwart/Abwesenheit von WISP1-AS1 zu vergleichen und WISP1-AS1-abhängige Veränderungen zu beobachten, wurde die WISP1-AS1 Expression durch Antisense-Oligonukleotide (ASOs) verhindert. Der Einfluss von WISP1-AS1 auf das Transkriptom und die Aktivität einiger Traskriptionfaktoren wurde durch RNASequenzierung untersucht. Diese Arbeit legt auch eine mögliche Beteiligung von WISP1-AS1 am normalen zellulären Energiestoffwechsel sowie am apoptotischen Geschehen nahe.

The worldwide spread mycotoxin ochratoxin A (OTA) contaminates the foodstuff and causes damage of human kidneys. By OTA treatment of human renal cells in culture, WISP1-AS1, a long non-coding RNA (lncRNA) in the WISP1 (CCN4) locus was discovered. OTA is so far the only known inducer of WISP1-AS1 whose functions were undiscovered. This research investigated WISP1-AS1 characteristics and functions in OTA toxicity and renal cancer cells. In human renal cells (HEK293T), WISP1-AS1 expression was upregulated only after OTA treatment. In renal cancer cells (786-O), WISP1-AS1 expression was tremendously high even without OTA treatment, indicating WISP1-AS1 possible implication in carcinogenesis. This work discovered WISP1-AS1 transcription in antisense in relation to the WISP1 mRNA. To compare cellular features in the presence/absence of WISP1-AS1 and observe WISP1-AS1-dependent changes, WISP1-AS1 was knocked down by antisense oligonucleotides (ASOs). The influence of WISP1-AS1 on transcriptome and the activity of some TFs was evaluated by RNA sequencing. This work also suggests possible WISP1-AS1 involvement in normal cellular energy metabolism and antiapoptotic processes.