Charakterisierung von AUF1-homologen Mosquito-Proteinen und deren Einfluss auf die RNA-Replikation des West-Nil-Virus

Abstract

Viren nutzen in verschiedenen Phasen ihres Lebenszyklus zahlreiche zelluläre Proteine der infizierten Wirtszelle. Zu diesen gehören das humane RNA-Bindeprotein AUF1p45, welches mit Hilfe von zwei RNA-Umstrukturierungsaktivitäten (RNA-Chaperon- und RNA-annealing-Aktivität) die Replikation von Flaviviren unterstützt. Im Rahmen dieser Arbeit wurden die zwei AUF1p45-homologen Proteine Squid-p30 und Squid-p32 aus Mosquitos charakterisiert. Sie zeigten eine Substratspezifität für AU/GU-reiche RNA und eine geringere Ausprägung der zwei RNA-Umstrukturierungsaktivitäten als AUF1p45. Ebenso stimulierten die Squid-Proteine die virale (-)-Strang-RNA-Synthese. Mit Hilfe einer Mutationsanalyse konnte der Einfluss von zwei Tryptophanen innerhalb eines YGG-Motivs von Squid-p32 auf die RNA-Bindung und RNA-Umstrukturierungsaktivitäten identifiziert werden. Anhand eines RNA-Thermometer-Modells wurde vermutet, dass sich die Wirtsfaktorfunktion von AUF1p45 erst in Vertebraten entwickelt hat.

Viruses depend on numerous cellular proteins during different phases of their viral life cycle. One of them is the human RNA binding protein AUF1p45 which promotes flaviviral replication by two RNA remodeling activities (RNA chaperone and RNA annealing activity). In this work the two AUF1-homologous mosquito proteins squid p30 and squid p32 were characterized. The squid proteins showed a substrate specificity for AU/GU-rich RNA and two RNA remodeling activities which were less pronounced than for AUF1p45. Furthermore, the squid proteins stimulated the viral negative-strand RNA synthesis. By means of a mutagenesis study the impact on RNA binding and RNA remodeling activities of two tryptophanes within a YGG motif of squid p32 could be identified. On the basis of a RNA thermometer model it is presumed that the role of AUF1p45 as a host factor has only evolved in vertebrates.