Eignung von Konzentrations- und Integritätsmessungen zellfreier Plasma-DNA als Biomarker zur Differenzierung von malignen und benignen Lungenerkrankungen

Abstract

Neben dem Nachweis genetischer und epigenetischer Alterationen eignet sich zellfreie DNA (cfDNA) auch für Konzentrations- und Integritätsmessungen. Bei Tumorpatienten wurden erhöhte cfDNAKonzentrations- und Integritätswerte im Vergleich zu Gesunden nachgewiesen. In dieser Arbeit wurde die Eignung von cfDNA-Konzentrations- und Integritätsmessungen als Biomarker zur Differenzierung von malignen und benignen Lungenerkrankungen untersucht. Aus Plasmaproben von 227 Patienten wurde cfDNA isoliert und die cfDNA-Konzentration von 3 ERV3-Fragmenten mittels quantitativer Real-Time-PCR bestimmt. Die cfDNA-Integrität wurde mit 2 Kalkulationsmethoden berechnet. Es wurden keine relevanten cfDNA-Konzentrations- und Integritätsunterschiede zwischen Lungenkarzinompatienten, Patienten mit benignen Lungenerkrankungen und Patienten mit einer anderen Tumorerkrankung als dem Bronchialkarzinom nachgewiesen. cfDNA-Konzentrations- und Integritätsmessungen waren als diagnostische Biomarker ungeeignet.

Cancer-related genetic and epigenetic alterations can be detected in cell free DNA (cfDNA). Furthermore, analyses of cfDNA concentrations and integrity can be used as potential diagnostic tools. Tumor patients showed an increase in quantity and integrity of cfDNA compared to healthy control groups. This study analyzed if cfDNA quantity and integrity measurements could serve as a diagnostic biomarker to distinguish lung cancer patients from patients with benign lung diseases. For this reason, cfDNA was isolated from plasma of 227 patients and cfDNA was amplified by real-time PCR. The quantity of 3 ERV3-fragments was determined and cfDNA integrity was calculated with 2 different methods. There were no differences found in cfDNA quantity and integrity between patients with lung cancer, patients with benign lung diseases and patients with other tumor diseases than lung cancer. Therefore, measurements of cfDNA quantity and integrity were found to be not useful as diagnostic biomarkers.