Structural characterization of the protein : protein interaction between the tumor suppressor p53 and S100β

Abstract

The transcription factor p53, being an tumor suppressor and an intrinsically disordered protein, has shown contradicting binding interaction towards S100β from reported peptide studies. In this thesis, different oligomeric states of p53 (monomeric, dimeric, and tetrameric) were investigated, regarding the stoichiometry, the site-specific interaction, and the binding affinities towards S100β. Experimental results have indicated that different oligomeric states of p53 show identical binding behavior towards the S100β homodimer. Using the integrative COMPASS approach, inter- and intra-protein cross-links within the S100β dimer were differentiated and more structural insight was revealed.

Der Transkriptionsfaktor p53, ein Tumorsuppressor und ein intrinsisch ungeordnetes Protein, hat aus berichteten Peptidstudien widersprüchliche Bindungsinteraktionen gegenüber S100β gezeigt. In dieser Arbeit wurden verschiedene oligomere Zustände von p53 (monomer, dimer und tetramer) hinsichtlich der Stöchiometrie, der standortspezifischen Interaktion und der Bindungsaffinitäten gegenüber S100β untersucht. Experimentelle Ergebnisse haben darauf hingedeutet, dass verschiedene oligomere Zustände von p53 ein identisches Bindungsverhalten gegenüber dem S100β-Homodimer zeigen. Unter Verwendung des integrativen COMPASS-Ansatzes wurden Inter- und Intraprotein-Kreuzvernetzungen innerhalb des S100β-Dimers differenziert und weitere strukturelle Einblicke wurden gewonnen.