Einzelnukleotid-Polymorphismus in TBC1D8B als genetische Risikovariante der chronischen Pankreatitis

Abstract

Die chronische Pankreatitis (CP) ist eine entzündliche Erkrankung der Bauchspeicheldrüse, die bei Betroffenen häufig mit einem hohen Leidensdruck einhergeht. Dieser wird einerseits durch rezidivierende Oberbauchschmerzen hervorgerufen, ebenso mündet die Entzündung häufig in einer endokrinen und exokrinen Insuffizienz. Die Hauptrisikofaktoren für die Entstehung einer CP sind Alkoholkonsum, Nikotin sowie eine Vielzahl genetischer Alterationen. Im Jahr 2012 wurde zwei genetische Risikofaktoren (SNPs) identifiziert, die in Assoziation mit der CP stehen, deren funktionelle Konsequenz bislang jedoch nicht geklärt wurde. In der vorliegenden Arbeit wurde mittels einer in silico Methode eine weite Variante identifiziert, die sich auf demselben Lokus der 2012 identifizierten Risikovarianten befindet. Dieser SNP wurde auf seine statistische Assoziation in Bezug auf die CP analysiert und mittels Reportergen-Analysen im Zellkulturmodell hinsichtlich seiner funktionellen Konsequenz untersucht.

Chronic pancreatitis (CP) is a pancreatic inflammatory disease, which is often associated with a high level of suffering in patients. On the one hand recurrent abdominal pain is often seen in affected individuals. On the other hand, chronic inflammation can cause an endocrine and exocrine insufficiency. Risk factors for the onset of CP are alcohol consumption, smoking and a large number of genetic alterations. In 2012 two genetic risk factors (SNPs) have been identified, which are associated with CP, however their functional consequences have not yet been elucidated. In the present work another variant (SNP), which is located on the same genetic locus as the variants found in 2012, was identified by an in silico method. This single nucleotide polymorphism (SNP) was examined for its statistical association with CP. Furthermore, the functional effect was analysed by reporter gene analyses in cultured cell lines.