Please use this identifier to cite or link to this item: http://dx.doi.org/10.25673/13514
Title: Usability of nuclear single-copy genes compared with plastid DNA on different phylogenetic levels of and within the order Poales
Author(s): Hochbach, Anne
Referee(s): Röser, Martin
Blattner, Frank
Braun, Uwe
Granting Institution: Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg
Issue Date: 2019
Extent: 1 Online-Ressource (66 Seiten)
Type: Hochschulschrift
Type: PhDThesis
Exam Date: Tag der Verteidigung: 29.01.2019
Language: English
Publisher: Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt
URN: urn:nbn:de:gbv:3:4-24287
Subjects: MatK; Phylogenie; PhyB; Poaceae; Poales; Pooideae; Restiid; single-copy Kerngen; Topo6
matK; nuclear single-copy gene; phylogeny; phyB; Poaceae; Poales; Pooideae; restiid; topo6
Abstract: Diese Arbeit untersucht die phylogenetische Systematik auf Ordnungsebene (Poales), Clade-Ebene (restiids), Familienebene (Bromeliceae und Poaceae) und Unterfamilienebene (Pooideae), um offene Fragen zu beantworten. Dazu wurden Stammbäume aus DNA-Sequenzen des Chloroplasten (matK-psbA) mit denen verschiedener single-copy Kerngene (Topo6, PhyB, Acc1) verglichen und die Verwendbarkeit der Marker getestet. Innerhalb der Poales konnten die Kerndaten keine neuen Erkenntnisse bringen. Die Daten unterstützen zwei Familien (Anarthriaceae, Restionaceae) innerhalb des restiid-Clades und die centrolepids als Unterfamilie Centrolepidoideae. Topo6 zeigt alle Großgruppen der Gräser monophyletisch. Der kombinierte Kerndatensatz unterstützt innerhalb der Pooideae alle anerkannten Triben und Subtiben. Verschiedene Klonsequenzen von Ampelodesmos (Acc1, Topo6) weisen auf einen hybridogenen Ursprung dieser monotypischen Gattung hin, mit Eltern in den Stipeae und den Duthieeae. Insgesamt erwiesen sich alle genutzten Abschnitte der single-copy Kerngene als geeignet für die phylogenetischen Untersuchungen.
This thesis investigates the phylogenetic systematics at the ordinal level (Poales), clade level (restiids), familial level (Bromeliaceae and Poaceae), and subfamilial level Pooideae with the aim to answer questions that have as of yet been unresolved. A plastid reference tree (matkpsbA) was compared with nuclear single-copy gene trees (Topo6, PhyB, Acc1). Within the Poales, the nuclear data could not bring any new insights. The data support two families within the restiid clade (Anarthriaceae, Restionaceae) and the centrolepids as subfamily Centrolepidoideae. Topo6 show the monophyly of all major groups of grasses. All established tribes and subtribes of the Pooideae are supported by the combined nuclear dataset. Different clone types of Ampelodesmos (Acc1, Topo6) suggests a hybrid origin of this monotypic genus, with a potential ancestor within the Stipeae and the Duthieeae. The used Marker regions of the nuclear sinlge-copy genes were altogether suitable for the phylogenetic investigations.
URI: https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/13610
http://dx.doi.org/10.25673/13514
Open Access: Open access publication
License: In CopyrightIn Copyright
Appears in Collections:Biowissenschaften; Biologie

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