Barley infected by powdery mildew - host transcriptome and proteome changes and the integration of both data sets

Abstract

Gerste als eine der Hauptgetreidearten spielt weltweit eine große Rolle in der Landwirtschaft. Der obligat biotrophe Pilz Blumeria graminis f.sp. hordei (Bgh) ist der Auslöser des weit verbreiteten Gerstenmehltaus.. Um zu überleben, muss die Pflanze den Befall durch Bgh erkennen und daraufhin ausreichende Abwehrmechanismen entwickeln. Für den Pilz hingegen ist die Unterdrückung der pflanzlichen Abwehr wichtig, und gleichzeitig die Gewährleistung fortlaufender Aufnahme von Nährstoffen. Das Ziel der vorliegenden Arbeit ist die Beschreibung und die Verknüpfung von Regulierungen des pflanzlichen Transkriptoms und Proteoms in der Interaktion zwischen Bgh und einer anfälligen Gerstensorte. Dies soll zu einem besseren Verständnis der Mechanismen der Anfälligkeit führen und könnte zusätzliche Steuerungsebenen wie Proteinstabilität oder post-translationelle Modifikationen aufzeigen. Die vorliegende Arbeit untersucht Epidermisproben von Gerstekeimlingen, in einem Zeitraum von 12 bis 120 Stunden nach Inokulation mit Bgh, und vergleicht sie mit Epidermisproben nichtinfizierter Kontrollpflanzen gleichen Alters. Die vergleichende Analyse beider Datensätze zeigte parallele als auch nichtparallele Regulierungen, welche unterschiedliche Kinetiken sowie Regulationsmechanismen auf post-transkriptioneller und post-translationeller Ebene aufzeigen.