Identification of new target genes of the transcriptional regulator Ets-related protein 71

Abstract

ER71 ist ein ETS-Transkriptionsfaktor, der die Gefäßbildung reguliert. Da die Überexpression von ER71 zu Gastrulationsdefekten führt, stellte ich ein Plasmidkonstrukt (ER71-GR) zur Expression eines Dexamethason-induzierbaren ER71-Proteins her. Ich konnte zeigen, dass zwei ER71-Zielgene, ami und lmo2, während der Froschentwicklung durch ER71 regulierbar waren. Die Anzahl der Zellen, die auf die Überexpression von ER71 reagieren, nahm zwischen st 10 und st 20 deutlich zu. Das Hauptziel dieser Arbeit war die Identifizierung neuer ER71-Zielgene. Daher überexprimierte ich ER71-GR in animalen Kappen. Die anschließende Behandlung mit Dexamethason führte reproduzierbar zur Induktion bekannter ER71-Zielgene. Zur Identifizierung neuer Zielgene nutzten wir die etablierte ‚RNA deepsequencing’ Technologie in Thomas Pielers Labor in Göttingen. Damit konnten wir eine Liste von ER71 regulierten Genen identifizieren, darunter viele neue potentielle ER71-Zielgene (Cplx2, march2, rgl2 und zeb2), deren Einfluss auf die Vaskulogenese bisher nicht gezeigt wurde

ER71 is an ETS transcription factor that regulates angiogenesis. Since the overexpression of ER71 leads to Gastrulation problems, I introduced a plasmid (ER71-GR) for the expression of a dexamethasone-inducible protein ER71 forth. I was able to show that two ER71-target genes, ami and LMO2, while the frog development were regulated by ER71. The number of cells that respond to the overexpression of ER71, took between stage 10 and stage 20 significantly. The main objective of this work was to identify new ER71-target genes. I therefore overexpressed ER71-GR in animal cap. Subsequent treatment with dexamethasone led to reproducible induction ER71 known target genes. To identify new target genes, we used the well-established, RNA deep sequencing 'technology in Thomas Pielers laboratory in Göttingen. This allowed us to identify a list of ER71 regulated genes, including many new potential ER71-target genes (Cplx2, march 2, rgl2 and zeb2), whose influence has not been shown to vasculogenesis.